للمركز مجلس إدارة خاص يسمى"مجلس المركز" ويشكّل وفق أحكام المادة (4/أ) من نظام المراكز العلمية في جامعة مؤتة رقم (37) لسنة2003م. وبناء على تنسيب الرئيس لمدة سنتين قابلة للتجديد, ويتكون هذا المجلس من:

- رئيس الجامعة رئيساً

- نواب الرئيس أعضاء

- مدير المركز عضواً

- مدير مركز الحاسوب عضواً

- ستة من أعضاء الهيئة التدريسية في الجامعة برتبة أستاذ مشارك, يختارهم رئيس الجامعة من التخصصات الإنسانية والعلمية بعد الاستئناس برأي مجلس العمداء ومدير المركز